1 交通荷载大幅增加
    经济发展导致车次增多，而车次的荷载量必然增加铁路运营成本，这也是修建铁路的目的。但是车次数量增多导致的荷载增加，对铁路隧道的铁轨造成很大的影响，造成的病害主要有诱发道路结构的拉力。
2 水害和冻害
    防水和防冻是一体的，杜绝水进入隧道的冻结圈，就可以有效的防治冻害，因此防水是关键。完善或补充隧道的地表和地下水; 在隧道的垭口以及隧道中地质不利地方实施截留以及引排水; 确保隧道内排水系统的贯通; 在隧道设置渗漏水的排水设施等; 在隧道的衬砌内装置防水层; 用止水带或者是膨胀橡胶密封施工缝或者变形缝等; 对于隧道严重漏水地方需要进行套拱加固。
3 衬砌裂损或侵蚀
    铁路隧道中衬砌发生裂损病害，需要及时消灭裂损危害，防止扩大裂损。同时及时的稳固围岩。隧道发生衬砌侵蚀主要是由于存在腐蚀介质，存在易腐蚀的物质或者是地下水活动性强。针对以上原因与条件，防止铁路侵蚀主要防治措施有: 进一步讲混凝土密实性提高，并增强衬砌整体性; 通过外掺加料方法，杜绝侵蚀; 水泥选用耐侵蚀型号，做好排水措施等。
4 其他病害
    除以上病害，隧道铁路还受到天气的影响，由于我国气候复杂多变，特别是北方地区四季分明，温差大，温度应力对隧道的铁轨造成影响，容易导致铁轨变形。另外，一些自然因素，比如山体滑坡、地震和洪水等，都会对隧道产生影响。一些施工遗留问题，同样是隧道铁路病害的隐形因素，处理不当会造成病害。